JUCTeが実施しているプログラムに、マレーシア日本高等教育プログラムがあります（以下MJHEPと表記）。MJHEP（Malaysia Japan Higher Education Program）は、3期22年にわたって実施された円借款事業、高等教育基金借款（Higher Education Loan Fund Project, HELP）I～IIIの後継事業として、マレーシア政府の予算によって運営されている日本留学プログラムです。
MJHEPでは、マレーシアの高校在学中に行われる統一学力テスト（SPM）成績上位5％の学生の中から日本留学を希望する学生を選抜し、3年間の教育（日本語を中心とした予備教育を1年、理工系大学１～2年次の学部教育を2年）を行います。現地教育の3年目（学部2年次）には、志望する大学の編入学試験を受験し、翌年4月には日本の大学に3年次編入をして日本での留学生活をスタートいたします
（3+2ツイニング）